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PSI-BLAST
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位點(diǎn)特異性迭代比對。是一種專門化的的比對,通過調(diào)節(jié)序列打分矩陣(scoringmatrix)探測遠(yuǎn)緣相關(guān)的蛋白。
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BLOSUM矩陣
答案:
模塊替代矩陣。矩陣中的每個(gè)位點(diǎn)的分值來自蛋白比對的局部塊中的替代頻率的觀察。每個(gè)矩陣適合特定的進(jìn)化距離。例如,在BLOS...
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PAM矩陣
答案:
PAM指可接受突變百分率。一個(gè)氨基酸在進(jìn)化中變成另一種氨基酸的可能性,通過這種可能性可以鑒定蛋白質(zhì)之間的相似性,并產(chǎn)生蛋...
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